تقع بلدة كوبر في محافظة رام الله والبيرة شمال الضفة الغربية، على بعد نحو عشرة كيلومترات إلى الشمال من مدينة رام الله، عند خط عرض 31°59′ شمالاً وخط طول 35°09′ شرقاً.
تنتشر البلدة على ربوة مرتفعة يتراوح ارتفاعها عن سطح البحر بين 590 و670 متراً، وتطل على سهول وأودية مزروعة بأشجار الزيتون التي تشكّل المشهد الطبيعي الأبرز فيها.
حدود البلدة: يحدّها من الشرق قرية برهام، ومن الشمال جيبيا وأم صفا، ومن الجنوب بلدة بيرزيت وتجمّع الزيتونة، ومن الغرب أراضٍ صودر جزء منها لصالح الاستيطان.
المناخ: تتمتع كوبر بمناخ البحر الأبيض المتوسط الجبلي؛ إذ يبلغ معدل هطول الأمطار السنوي نحو 669.8 ملم، ومتوسط درجة الحرارة السنوي نحو 16 درجة مئوية، ومعدل الرطوبة النسبية نحو 61%.